Plateforme de Bio-informatique

La plateforme de bio-informatique de l’Institut Mondor de Recherche Biomédicale est créée en 2017 pour offrir aux équipes de recherche de l’IMRB, et plus généralement à l’UPEC (Université Paris-Est Créteil) et aux extérieurs :

 

  • – un accès à des moyens de calculs
    Création d’un compte et d’un espace de travail
    Accès aux moyens de calcul via un schéduleur (slurm)
    Accès aux logiciels et banques installées
    Possibilité d’installer, de déployer en local des pipelines et des banques dédiées.

 

  • – un accompagnement avec réalisations d’analyses bio-informatiques
    Conseil en amont des analyses bio-informatiques et/ou bio statistiques
    Prise en charge de l’analyse bio-informatique et rendu des résultats
    Formation et/ou aide

 

  • – une expertise bio-informatique

 

  • Exemple de pipelines/prestations:
    – recherche de variants
    – Méta génomique (16S/WGS)
    – ChIP-seq
    – RNA-seq
    – modélisation de systèmes biologiques

 

  • Equipements :
    – 1 serveur de calcul composé de 8 nœuds 16C (64Go RAM par nœud + GPU) et 4 nœuds 16C (512Go RAM par nœud + GPU)
    – 1 serveur de calcul composé de 2 nœuds de 16C et 512 Go RAM par nœud
    – stockage local
    – baie disque 25 To

Localisation :
IMRB-U955
2ème étage de la Faculté de Médecine de Créteil
Porte 2037
8 rue du Général SARRAIL
94010 Créteil

Contact :
bioinfo.imrb@inserm.fr